Bacigalupo asume entre enero y julio del 2016. En aquel momento reemplazó a Sheila Abed, quien fue designada como consejera de la Entidad Binacional Yacyretá.
"Yo no quiero mirar hacia el pasado, quiero hacer una mirada hacia el presente y el futuro", declaró Bacigalupo a la prensa sobre el actual mandatario, luego de que el presidente electo anunciara su designación.
Cartes la había destituido tras la polémica que se armó por el caso Jarvis Pavão. A mediados de julio del 2016, se encontró dinamita en uno de los muros del Penal de Tacumbú y se ordenó el traslado de reclusos, entre ellos el del brasileño procesado por lavado de dinero y condenado en su país por narcotráfico.